Suomen Akatemia
Rahoituspäätös
 
Hakija / Yhteyshenkilö Häkkinen, Antti
Organisaatio Helsingin yliopisto
Tutkimusaihe Tehokkaiden laskennallisten menetelmien kehitys big data -analysiin syövässä yksittäisten solujen tasolla
Päätös 322927
Päätöspvm 07.05.2019
Rahoituskausi 01.09.2019 - 31.08.2022
Rahoitus (€) 277 880
WebFOCUS Report
Hankkeen julkinen kuvaus
Nykyaikainen syöpätutkimus nojaa uuden sukupolven sekvenointimenetelmiin, jotka mahdollistavat potilaskudosnäytteiden genomilaajuisen profiloinnin useilla molekyylitasoilla. Uudet yksittäisten solujen menetelmät mahdollistavat vieläkin syvemmän mittauksen, paljastaen kasvainten koostumuksen ja yksittäisten solujen käyttäytymisen. Rajoittava tekijä analyysissa on tulkinta ja kääntäminen biologiseksi ymmärrykseksi, sillä aikaisemmat analyysit soveltuvat heikosti uuden datan piirteisiin ja paljouteen, jättäen suuren osan informaatiosta hyödyntämättä. Tässä projektissa kehitämme uusia laskennallisia menetelmiä yksittäissoludatan analysoimiseksi. Sovellamme menetelmiä munasarjasyöpäpotilaiden dataan, tunnistaaksemme mitkä mekanismit aiheuttavat syöpälääkkeiden vastustuskykyä, johtaen tehottomaan hoitoon ja potilaan kuolemaan. Uusia menetelmiä tarvitaan kipeästi tällä saralla, jotta valtavat datamäärät voidaan kääntää tehokkaiksi hoitomenetelmiksi parantamaan potilaiden selviytymistä.